El Área de Administración cumple las funciones de:

1. Coordinación para la elaboración del Programa Operativo Anual y su seguimiento.
2. Formulación, ejecución y evaluación del presupuesto por fuente y organismo financiador.
3. Elaboración de los estados financieros institucionales.
4. Elaboración de los POAI's del personal administrativo.
5. Coordinación de la implantación de la evaluación del desempeño del personal de planta y consultores de línea
6. Administración de los activos fijos y almacenes.
7. Apoyo y asesoramiento a la Dirección General Ejecutiva y Programas de la institución.
8. Coordinación permanente con el Ministerio de Hacienda, Planificación del Desarrollo y Contraloría General de la República.